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Formation Galaxy - Octobre 2013

Lundi 7 octobre:

  • 9h-10h : présentation générale de Galaxy, et de son contexte d'utilisation.

Jean-François Dufayard, Félix Homa, Marilyne Summo.

Support de cours (Cours_Galaxy_octobre_2013.pdf)

  • 10h15-12h15 : travaux pratiques sur Galaxy, des données aux workflows.

Jean-François Dufayard, Félix Homa, Marilyne Summo.

Support de TP (TP-Galaxy-07-13-13.doc)

Données pour les questions subsidiaires: reference.fasta input1.fastq input2.fastq

  • 13h30-17h30 : mise en application sur des données réelles.

Jean-François Dufayard, Félix Homa, Marilyne Summo. Avec la participation supplémentaire de membres de la plateforme Southgreen.

Support du TP de mise en autonomique (Initiation_à_Galaxy_en_autonomie.pdf)

Intervenants:

  
  • Jean-François Dufayard (chercheur CIRAD). 
 Email: jean-francois.dufayard -at- cirad.fr
  • Félix Homa (IE CIRAD). 
 Email: felix.homa -at- cirad.fr
  • Stéphanie Pointet (IE CIRAD). 
 Email: stephanie.pointet -at- cirad.fr
  • Marilyne Summo (Chercheuse CIRAD). 
 Email: marilyne.summo -at- cirad.fr